graphpad怎么做平滑曲線?手把手教你用Graphpad繪制生存曲線

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首先必須得是XY類型的圖表,在數(shù)據(jù)分析的窗口中有個(gè)XY analyses,第三個(gè)選個(gè)是Fit Spline/LOWESS. 點(diǎn)進(jìn)去以后用第一個(gè)選項(xiàng)Cubic Spline,其余都用默認(rèn)的就行了。最后回到graph里面再看就全變成曲線啦。我用的是MAC版的prism 6
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在臨床研究中,生存曲線(又稱Kaplan-Meier曲線)是最常用圖片之一,旨在描述各組患者的生存狀況。一張漂亮的、專業(yè)的生存曲線圖不僅可以令編輯、讀者和審稿專家眼前一亮,同時(shí)也能為論文增色不少。然而,對(duì)于一些新手而言,生存曲線卻顯得十分陌生,不知道為何要繪制生存曲線,也不知道該如何解讀生存曲線的結(jié)果。

如何解讀生存曲線呢?

(1)對(duì)于生存曲線,樣本量越大,生存曲線越平滑,誤差越小。

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(2)一般而言,兩條曲線之間的距離越大(分叉越大),說明兩組患者預(yù)后(終點(diǎn)事件發(fā)生率)的差別越大,也越容易做出統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。其實(shí)這個(gè)和t檢驗(yàn)差不多:兩組數(shù)據(jù)的均數(shù)差異越大,越容易有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。丟塔游戲網(wǎng)www.diuta.com

(3)隨訪時(shí)間越長,越容易做出統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。這個(gè)問題其實(shí)也很好理解,一個(gè)極端的比方就是,在上述sST2例子中,假定隨訪時(shí)間為1天,而非400天,兩組患者生存率的差異顯然是沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的。國際上,隨訪時(shí)間越長的研究越容易發(fā)表在高水平的雜志上,原因與此有關(guān)。

(4)樣本量越大,越容易做出統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。樣本量越大,誤差(標(biāo)準(zhǔn)誤)越小,當(dāng)然越有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。其實(shí)這相當(dāng)于在t檢驗(yàn)中,兩組數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)差越小,當(dāng)然越容易得到陽性統(tǒng)計(jì)學(xué)結(jié)果。

(5)生存曲線與X軸有交叉,并不意味著研究對(duì)象全部死亡(發(fā)生終點(diǎn)事件)。實(shí)際上,在生存曲線中,每一個(gè)時(shí)間點(diǎn)上只要有病人死亡(或者發(fā)生終點(diǎn)事件),曲線就會(huì)下降一定的幅度。(參考知乎oriRNA)

接下來,我們就用Graphpad prism9,和大家一起看看如何繪制生存曲線。

1. Survival curve-生存曲線

在有關(guān)差異表達(dá)基因和生物標(biāo)志物模型分析中,經(jīng)常會(huì)見到生存曲線分析。

(1)創(chuàng)建

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(2)寫入/導(dǎo)入數(shù)據(jù)

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(3)Graphs

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(4)結(jié)果,治療組與對(duì)照組沒有顯著性差異。

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(5)調(diào)整后的Graphs

雙擊圖,彈出如下窗口,就可以編輯line的顏色等等。

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(6)雙擊Y軸添加參考線。大多數(shù)研究會(huì)討論中位生存時(shí)間。

雙擊Y軸,在”Additionalticks and grid lines“中寫入0.5 (如果開始作圖時(shí)選擇”Percents“這里應(yīng)寫入50)點(diǎn)選 TickLine在Details按鈕中選擇參考線的顏色和線型即可。同樣,也可以去添加X軸的參考線。

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